Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna4O35343 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Kpna4O35343 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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