Protein–RNA interactions for Protein: O35257

Prl6a1, Prolactin-6A1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl6a1O35257 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prl6a1O35257 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prl6a1O35257 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prl6a1O35257 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prl6a1O35257 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prl6a1O35257 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prl6a1O35257 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prl6a1O35257 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prl6a1O35257 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prl6a1O35257 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prl6a1O35257 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prl6a1O35257 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prl6a1O35257 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prl6a1O35257 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prl6a1O35257 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prl6a1O35257 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prl6a1O35257 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prl6a1O35257 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms