Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Pkd2O35245 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pkd2O35245 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pkd2O35245 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pkd2O35245 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms