Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kif3cO35066 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif3cO35066 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif3cO35066 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif3cO35066 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif3cO35066 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif3cO35066 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms