Protein–RNA interactions for Protein: O08967

Cyth3, Cytohesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth3O08967 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cyth3O08967 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cyth3O08967 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyth3O08967 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyth3O08967 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms