Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NumblO08919 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NumblO08919 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NumblO08919 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NumblO08919 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NumblO08919 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NumblO08919 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NumblO08919 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NumblO08919 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NumblO08919 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NumblO08919 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NumblO08919 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NumblO08919 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NumblO08919 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NumblO08919 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NumblO08919 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NumblO08919 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NumblO08919 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NumblO08919 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NumblO08919 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NumblO08919 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NumblO08919 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NumblO08919 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NumblO08919 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NumblO08919 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NumblO08919 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NumblO08919 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NumblO08919 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NumblO08919 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NumblO08919 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NumblO08919 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NumblO08919 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NumblO08919 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NumblO08919 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NumblO08919 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NumblO08919 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NumblO08919 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NumblO08919 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NumblO08919 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NumblO08919 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NumblO08919 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NumblO08919 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NumblO08919 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NumblO08919 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NumblO08919 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NumblO08919 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NumblO08919 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NumblO08919 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NumblO08919 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NumblO08919 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NumblO08919 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NumblO08919 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NumblO08919 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NumblO08919 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NumblO08919 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NumblO08919 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NumblO08919 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NumblO08919 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NumblO08919 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NumblO08919 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NumblO08919 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NumblO08919 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NumblO08919 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NumblO08919 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NumblO08919 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NumblO08919 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NumblO08919 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NumblO08919 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NumblO08919 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NumblO08919 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NumblO08919 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NumblO08919 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NumblO08919 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NumblO08919 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NumblO08919 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NumblO08919 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NumblO08919 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NumblO08919 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NumblO08919 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NumblO08919 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NumblO08919 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NumblO08919 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NumblO08919 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NumblO08919 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NumblO08919 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NumblO08919 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NumblO08919 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NumblO08919 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NumblO08919 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NumblO08919 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NumblO08919 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NumblO08919 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NumblO08919 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NumblO08919 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NumblO08919 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NumblO08919 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NumblO08919 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NumblO08919 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NumblO08919 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NumblO08919 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms