Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkcshO08795 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PrkcshO08795 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrkcshO08795 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrkcshO08795 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrkcshO08795 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkcshO08795 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkcshO08795 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkcshO08795 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms