Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MttpO08601 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MttpO08601 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MttpO08601 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MttpO08601 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MttpO08601 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MttpO08601 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MttpO08601 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MttpO08601 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MttpO08601 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MttpO08601 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MttpO08601 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MttpO08601 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MttpO08601 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MttpO08601 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MttpO08601 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MttpO08601 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MttpO08601 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MttpO08601 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MttpO08601 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MttpO08601 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MttpO08601 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MttpO08601 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MttpO08601 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MttpO08601 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MttpO08601 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MttpO08601 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MttpO08601 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MttpO08601 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MttpO08601 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MttpO08601 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MttpO08601 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MttpO08601 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MttpO08601 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MttpO08601 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MttpO08601 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MttpO08601 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MttpO08601 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MttpO08601 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MttpO08601 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MttpO08601 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MttpO08601 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MttpO08601 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MttpO08601 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
MttpO08601 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MttpO08601 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MttpO08601 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MttpO08601 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MttpO08601 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MttpO08601 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MttpO08601 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MttpO08601 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MttpO08601 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MttpO08601 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MttpO08601 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MttpO08601 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MttpO08601 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MttpO08601 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MttpO08601 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MttpO08601 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MttpO08601 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MttpO08601 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MttpO08601 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MttpO08601 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MttpO08601 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MttpO08601 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MttpO08601 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MttpO08601 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MttpO08601 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MttpO08601 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MttpO08601 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MttpO08601 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MttpO08601 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MttpO08601 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MttpO08601 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MttpO08601 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MttpO08601 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MttpO08601 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MttpO08601 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MttpO08601 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MttpO08601 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MttpO08601 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MttpO08601 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MttpO08601 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MttpO08601 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MttpO08601 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MttpO08601 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MttpO08601 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MttpO08601 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MttpO08601 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MttpO08601 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MttpO08601 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MttpO08601 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MttpO08601 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MttpO08601 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MttpO08601 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MttpO08601 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MttpO08601 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MttpO08601 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MttpO08601 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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