Protein–RNA interactions for Protein: K9J7G2

Gm8653, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8653K9J7G2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8653K9J7G2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8653K9J7G2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms