Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5294J3QP53 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5294J3QP53 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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