Protein–RNA interactions for Protein: J3QP07

B020004C17Rik, RIKEN cDNA B020004C17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020004C17RikJ3QP07 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
B020004C17RikJ3QP07 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
B020004C17RikJ3QP07 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B020004C17RikJ3QP07 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms