Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm28051J3QMA2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms