Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pot1bH7BX60 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pot1bH7BX60 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pot1bH7BX60 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms