Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r34G3XA52 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r34G3XA52 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms