Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Arfgef1G3X9K3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arfgef1G3X9K3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arfgef1G3X9K3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms