Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r176G3UW31 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r176G3UW31 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r176G3UW31 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.7 ms