Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Farp1F8VPU2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Farp1F8VPU2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Farp1F8VPU2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms