Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm20538F6Z9R1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm20538F6Z9R1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms