Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sptbn5F6UCX4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sptbn5F6UCX4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sptbn5F6UCX4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms