Protein–RNA interactions for Protein: F6S200

Plekhg1, Pleckstrin homology domain-containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhg1F6S200 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Plekhg1F6S200 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Plekhg1F6S200 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Plekhg1F6S200 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plekhg1F6S200 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms