Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Taf4E9QAP7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Taf4E9QAP7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Taf4E9QAP7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.4 ms