Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cald1E9QA15 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cald1E9QA15 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Cald1E9QA15 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cald1E9QA15 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cald1E9QA15 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms