Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc74aE9Q9U8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms