Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mcmdc2E9Q956 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mcmdc2E9Q956 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms