Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc71lE9Q4T4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms