Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms