Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ldlrad1D3YYZ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ldlrad1D3YYZ1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms