Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17333C6EQI3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17333C6EQI3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17333C6EQI3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17333C6EQI3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm17333C6EQI3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17333C6EQI3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17333C6EQI3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms