Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Polr3aB2RXC6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Polr3aB2RXC6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Polr3aB2RXC6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Polr3aB2RXC6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms