Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trappc11B2RXC1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc11B2RXC1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms