Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brpf1B2RRD7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brpf1B2RRD7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brpf1B2RRD7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms