Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Mbd5B1AYB6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Mbd5B1AYB6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Mbd5B1AYB6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Mbd5B1AYB6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Mbd5B1AYB6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms