Protein–RNA interactions for Protein: B1AWM0

Cnbd1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd1B1AWM0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cnbd1B1AWM0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnbd1B1AWM0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnbd1B1AWM0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms