Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930402K13RikB1AW18 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930402K13RikB1AW18 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930402K13RikB1AW18 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms