Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem238A9JSM3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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