Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trgv2A2J008 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trgv2A2J008 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trgv2A2J008 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trgv2A2J008 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trgv2A2J008 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trgv2A2J008 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trgv2A2J008 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trgv2A2J008 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trgv2A2J008 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trgv2A2J008 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Trgv2A2J008 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trgv2A2J008 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trgv2A2J008 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trgv2A2J008 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms