Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms