Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rhbdl2A2AGA4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rhbdl2A2AGA4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rhbdl2A2AGA4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms