Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pramef6A2A8M8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pramef6A2A8M8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef6A2A8M8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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