Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms