Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms