Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn8Q9Z260 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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