Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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AmfrQ9R049 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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AmfrQ9R049 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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AmfrQ9R049 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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AmfrQ9R049 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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AmfrQ9R049 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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AmfrQ9R049 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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AmfrQ9R049 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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AmfrQ9R049 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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AmfrQ9R049 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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AmfrQ9R049 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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AmfrQ9R049 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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AmfrQ9R049 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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AmfrQ9R049 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AmfrQ9R049 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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