Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Col5a3Q9JLI2 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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