Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn2Q9ER65 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clstn2Q9ER65 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms