Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ccdc7Q9D541 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Ccdc7Q9D541 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc7Q9D541 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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