Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms