Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SdhdQ9CXV1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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