Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Chmp3Q9CQ10 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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