Protein–RNA interactions for Protein: Q99P69

Nuf2, Kinetochore protein Nuf2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nuf2Q99P69 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nuf2Q99P69 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nuf2Q99P69 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms